Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX1P55347 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX1P55347 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKNOX1P55347 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX1P55347 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms