Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC12A2P55011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC12A2P55011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A2P55011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A2P55011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms