Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A3P53794 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A3P53794 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A3P53794 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms