Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLTCL1P53675 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLTCL1P53675 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CLTCL1P53675 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLTCL1P53675 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCL1P53675 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCL1P53675 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms