Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASPP50552 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASPP50552 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VASPP50552 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VASPP50552 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASPP50552 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASPP50552 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASPP50552 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASPP50552 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASPP50552 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASPP50552 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VASPP50552 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASPP50552 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASPP50552 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VASPP50552 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VASPP50552 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VASPP50552 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VASPP50552 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VASPP50552 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VASPP50552 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VASPP50552 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VASPP50552 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VASPP50552 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VASPP50552 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VASPP50552 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VASPP50552 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VASPP50552 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VASPP50552 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VASPP50552 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VASPP50552 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VASPP50552 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VASPP50552 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VASPP50552 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VASPP50552 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VASPP50552 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VASPP50552 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VASPP50552 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASPP50552 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASPP50552 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASPP50552 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASPP50552 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASPP50552 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VASPP50552 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VASPP50552 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VASPP50552 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VASPP50552 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VASPP50552 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VASPP50552 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VASPP50552 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VASPP50552 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VASPP50552 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VASPP50552 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VASPP50552 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VASPP50552 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASPP50552 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VASPP50552 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASPP50552 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASPP50552 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VASPP50552 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VASPP50552 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VASPP50552 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VASPP50552 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASPP50552 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASPP50552 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASPP50552 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASPP50552 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASPP50552 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VASPP50552 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms