Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN2P49810 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN2P49810 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSEN2P49810 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms