Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NMUP48645 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMUP48645 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMUP48645 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMUP48645 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMUP48645 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMUP48645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMUP48645 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMUP48645 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMUP48645 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMUP48645 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NMUP48645 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMUP48645 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMUP48645 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NMUP48645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMUP48645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMUP48645 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMUP48645 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMUP48645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMUP48645 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMUP48645 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMUP48645 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMUP48645 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMUP48645 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMUP48645 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMUP48645 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMUP48645 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMUP48645 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMUP48645 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMUP48645 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMUP48645 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMUP48645 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMUP48645 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMUP48645 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMUP48645 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMUP48645 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMUP48645 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMUP48645 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMUP48645 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMUP48645 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMUP48645 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMUP48645 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms