Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA4P48169 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABRA4P48169 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms