Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC1A4P43007 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC1A4P43007 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A4P43007 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms