Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSG1P42857 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSG1P42857 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSG1P42857 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSG1P42857 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NSG1P42857 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NSG1P42857 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSG1P42857 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSG1P42857 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSG1P42857 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSG1P42857 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSG1P42857 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSG1P42857 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSG1P42857 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSG1P42857 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSG1P42857 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSG1P42857 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSG1P42857 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSG1P42857 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSG1P42857 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSG1P42857 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSG1P42857 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSG1P42857 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSG1P42857 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSG1P42857 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSG1P42857 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSG1P42857 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSG1P42857 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSG1P42857 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSG1P42857 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSG1P42857 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSG1P42857 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSG1P42857 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSG1P42857 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSG1P42857 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSG1P42857 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSG1P42857 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSG1P42857 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSG1P42857 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSG1P42857 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSG1P42857 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSG1P42857 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSG1P42857 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSG1P42857 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSG1P42857 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSG1P42857 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSG1P42857 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSG1P42857 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSG1P42857 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSG1P42857 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSG1P42857 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSG1P42857 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSG1P42857 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSG1P42857 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSG1P42857 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSG1P42857 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSG1P42857 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSG1P42857 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSG1P42857 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSG1P42857 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSG1P42857 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSG1P42857 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSG1P42857 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSG1P42857 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSG1P42857 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSG1P42857 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSG1P42857 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSG1P42857 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSG1P42857 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSG1P42857 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSG1P42857 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSG1P42857 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSG1P42857 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSG1P42857 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSG1P42857 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSG1P42857 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSG1P42857 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSG1P42857 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSG1P42857 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms