Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCIP41743 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCIP41743 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCIP41743 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms