Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 PRS4YBL068W 981 nt10.43□□□□□ -0.74
SSM4P40318 DPM1YPR183W 804 nt10.43□□□□□ -0.74
SSM4P40318 SFP1YLR403W 2052 nt10.42□□□□□ -0.74
SSM4P40318 PFS2YNL317W 1398 nt10.42□□□□□ -0.74
SSM4P40318 MET2YNL277W 1461 nt10.41□□□□□ -0.74
SSM4P40318 DCR2YLR361C 1737 nt10.41□□□□□ -0.74
SSM4P40318 YPR130CYPR130C 408 nt10.4□□□□□ -0.74
SSM4P40318 NAF1YNL124W 1479 nt10.4□□□□□ -0.75
SSM4P40318 TPI1YDR050C 747 nt10.39□□□□□ -0.75
SSM4P40318 NFS1YCL017C 1494 nt10.39□□□□□ -0.75
SSM4P40318 DMC1YER179W 1005 nt10.38□□□□□ -0.75
SSM4P40318 AFG3YER017C 2286 nt10.38□□□□□ -0.75
SSM4P40318 HMG2YLR450W 3138 nt10.38□□□□□ -0.75
SSM4P40318 URA1YKL216W 945 nt10.37□□□□□ -0.75
SSM4P40318 RDR1YOR380W 1641 nt10.37□□□□□ -0.75
SSM4P40318 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt10.34□□□□□ -0.75
SSM4P40318 YJL213WYJL213W 996 nt10.33□□□□□ -0.76
SSM4P40318 MCP1YOR228C 909 nt10.33□□□□□ -0.76
SSM4P40318 SPE3YPR069C 882 nt10.33□□□□□ -0.76
SSM4P40318 TOP3YLR234W 1971 nt10.32□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YER152CYER152C 1332 nt10.32□□□□□ -0.76
SSM4P40318 TCB1YOR086C 3561 nt10.32□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YRF1-2YER190W 5046 nt10.32□□□□□ -0.76
SSM4P40318 LIP5YOR196C 1245 nt10.32□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YJL144WYJL144W 315 nt10.31□□□□□ -0.76
SSM4P40318 PUS4YNL292W 1212 nt10.31□□□□□ -0.76
SSM4P40318 FRE6YLL051C 2139 nt10.3□□□□□ -0.76
SSM4P40318 DML1YMR211W 1428 nt10.3□□□□□ -0.76
SSM4P40318 PAM17YKR065C 594 nt10.3□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YLR030WYLR030W 792 nt10.3□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YCL049CYCL049C 939 nt10.3□□□□□ -0.76
SSM4P40318 PGI1YBR196C 1665 nt10.29□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YGL260WYGL260W 231 nt10.29□□□□□ -0.76
SSM4P40318 YLR162WYLR162W 357 nt10.29□□□□□ -0.76
SSM4P40318 CIA1YDR267C 993 nt10.28□□□□□ -0.76
SSM4P40318 SNF7YLR025W 723 nt10.28□□□□□ -0.76
SSM4P40318 PET117YER058W 324 nt10.27□□□□□ -0.77
SSM4P40318 BIO3YNR058W 1443 nt10.26□□□□□ -0.77
SSM4P40318 CIT2YCR005C 1383 nt10.26□□□□□ -0.77
SSM4P40318 RTC4YNL254C 1206 nt10.26□□□□□ -0.77
SSM4P40318 CDC7YDL017W 1524 nt10.26□□□□□ -0.77
SSM4P40318 ERG27YLR100W 1044 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 LDB7YBL006C 543 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 YOR041CYOR041C 432 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 LGE1YPL055C 999 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 YPL264CYPL264C 1062 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 MPH3YJR160C 1809 nt10.25□□□□□ -0.77
SSM4P40318 ERG24YNL280C 1317 nt10.24□□□□□ -0.77
SSM4P40318 YMR074CYMR074C 438 nt10.24□□□□□ -0.77
SSM4P40318 RTC2YBR147W 891 nt10.24□□□□□ -0.77
SSM4P40318 UFD1YGR048W 1086 nt10.23□□□□□ -0.77
SSM4P40318 PLB2YMR006C 2121 nt10.23□□□□□ -0.77
SSM4P40318 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.22□□□□□ -0.77
SSM4P40318 YKL147CYKL147C 618 nt10.22□□□□□ -0.77
SSM4P40318 HXT9YJL219W 1704 nt10.21□□□□□ -0.77
SSM4P40318 MSS51YLR203C 1311 nt10.21□□□□□ -0.77
SSM4P40318 YDR327WYDR327W 327 nt10.2□□□□□ -0.78
SSM4P40318 GNA1YFL017C 480 nt10.2□□□□□ -0.78
SSM4P40318 SML1YML058W 315 nt10.2□□□□□ -0.78
SSM4P40318 EXG2YDR261C 1689 nt10.2□□□□□ -0.78
SSM4P40318 GET4YOR164C 939 nt10.19□□□□□ -0.78
SSM4P40318 YCR049CYCR049C 447 nt10.17□□□□□ -0.78
SSM4P40318 MPE1YKL059C 1326 nt10.17□□□□□ -0.78
SSM4P40318 PLB3YOL011W 2061 nt10.16□□□□□ -0.78
SSM4P40318 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt10.15□□□□□ -0.78
SSM4P40318 TUB1YML085C 1344 nt10.15□□□□□ -0.78
SSM4P40318 BRN1YBL097W 2265 nt10.14□□□□□ -0.79
SSM4P40318 YPQ2YDR352W 954 nt10.14□□□□□ -0.79
SSM4P40318 CDC23YHR166C 1881 nt10.14□□□□□ -0.79
SSM4P40318 MAL31YBR298C 1845 nt10.14□□□□□ -0.79
SSM4P40318 CTA1YDR256C 1548 nt10.14□□□□□ -0.79
SSM4P40318 ERR3YMR323W 1314 nt10.13□□□□□ -0.79
SSM4P40318 ERG10YPL028W 1197 nt10.12□□□□□ -0.79
SSM4P40318 URA8YJR103W 1737 nt10.11□□□□□ -0.79
SSM4P40318 RMD8YFR048W 1989 nt10.11□□□□□ -0.79
SSM4P40318 NUP57YGR119C 1626 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 HPT1YDR399W 666 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 GTS1YGL181W 1191 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 HTZ1YOL012C 405 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 YOL046CYOL046C 675 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 YKR018CYKR018C 2178 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 YLL058WYLL058W 1728 nt10.09□□□□□ -0.79
SSM4P40318 YOR111WYOR111W 699 nt10.08□□□□□ -0.8
SSM4P40318 PRC1YMR297W 1599 nt10.08□□□□□ -0.8
SSM4P40318 FCY2YER056C 1602 nt10.08□□□□□ -0.8
SSM4P40318 YJL163CYJL163C 1668 nt10.08□□□□□ -0.8
SSM4P40318 YNR005CYNR005C 405 nt10.07□□□□□ -0.8
SSM4P40318 FLC2YAL053W 2352 nt10.07□□□□□ -0.8
SSM4P40318 CYS4YGR155W 1524 nt10.06□□□□□ -0.8
SSM4P40318 APE4YHR113W 1473 nt10.05□□□□□ -0.8
SSM4P40318 YIP4YGL198W 708 nt10.04□□□□□ -0.8
SSM4P40318 AIM34YMR003W 597 nt10.04□□□□□ -0.8
SSM4P40318 NTG2YOL043C 1143 nt10.04□□□□□ -0.8
SSM4P40318 RPL43AYPR043W 279 nt10.04□□□□□ -0.8
SSM4P40318 AGX1YFL030W 1158 nt10.03□□□□□ -0.8
SSM4P40318 THR1YHR025W 1074 nt10.03□□□□□ -0.8
SSM4P40318 AAD14YNL331C 1131 nt10.03□□□□□ -0.8
SSM4P40318 CHA1YCL064C 1083 nt10.02□□□□□ -0.81
SSM4P40318 YAL045CYAL045C 309 nt10.01□□□□□ -0.81
SSM4P40318 SPE4YLR146C 903 nt10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.2 ms