Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 AIM34YMR003W 597 nt7.46□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MOB1YIL106W 945 nt7.45□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YNL190WYNL190W 615 nt7.45□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 TSR3YOR006C 942 nt7.45□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YHR131CYHR131C 2553 nt7.45□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 ERP5YHR110W 639 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 CHS7YHR142W 951 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 AIM2YAL049C 741 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 OMA1YKR087C 1038 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 RCF1YML030W 480 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 GFD1YMR255W 567 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MRP7YNL005C 1116 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 PEX27YOR193W 1131 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 WSC3YOL105C 1671 nt7.44□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MET30YIL046W 1923 nt7.43□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MET22YOL064C 1074 nt7.43□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 OLA1YBR025C 1185 nt7.43□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YPL264CYPL264C 1062 nt7.43□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 GPI18YBR004C 1302 nt7.43□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 TOM71YHR117W 1920 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 ARO3YDR035W 1113 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YKR075CYKR075C 924 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 NSG2YNL156C 900 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 VAM3YOR106W 852 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 SAS4YDR181C 1446 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 PRC1YMR297W 1599 nt7.42□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 SGF73YGL066W 1974 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MED2YDL005C 1296 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 YGR137WYGR137W 375 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 AIR1YIL079C 1083 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 TSR2YLR435W 618 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 RRP40YOL142W 723 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 ITR1YDR497C 1755 nt7.41□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 WHI4YDL224C 1950 nt7.4□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 PET18YCR020C 648 nt7.4□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 RRT6YGL146C 936 nt7.4□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 MHO1YJR008W 1017 nt7.4□□□□□ -1.22
YAR028WP39548 HXT9YJL219W 1704 nt7.39□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 DML1YMR211W 1428 nt7.39□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PAU5YFL020C 369 nt7.39□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 FLX1YIL134W 936 nt7.39□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 ISA2YPR067W 558 nt7.39□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YLR173WYLR173W 1827 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PDC6YGR087C 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 BEM1YBR200W 1656 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 MUM3YOR298W 1440 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YPR1YDR368W 939 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YHR022CYHR022C 771 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 DSC2YOL073C 969 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PMT1YDL095W 2454 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 RSC9YML127W 1746 nt7.38□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YER152CYER152C 1332 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 SRP102YKL154W 735 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 SPE4YLR146C 903 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YLR280CYLR280C 351 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PHA2YNL316C 1005 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 LAS17YOR181W 1902 nt7.37□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 snR57snR57 88 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YDL158CYDL158C 309 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 STP3YLR375W 1032 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 ELP6YMR312W 822 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YNL319WYNL319W 441 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 ALG5YPL227C 1005 nt7.36□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 CYC3YAL039C 810 nt7.35□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PGC1YPL206C 966 nt7.35□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 RHO1YPR165W 630 nt7.35□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 OCH1YGL038C 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 ARO10YDR380W 1908 nt7.35□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 TPO1YLL028W 1761 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 CHA1YCL064C 1083 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YCR006CYCR006C 474 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 PUP3YER094C 618 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 CKB1YGL019W 837 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 YGR066CYGR066C 879 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 OPI1YHL020C 1215 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 HEM15YOR176W 1182 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 SLX1YBR228W 915 nt7.34□□□□□ -1.23
YAR028WP39548 CLB5YPR120C 1308 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 ADH7YCR105W 1086 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 TIF2YJL138C 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 TIF1YKR059W 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 MTQ1YNL063W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 IPL1YPL209C 1104 nt7.33□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 HXT8YJL214W 1710 nt7.32□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 SHC1YER096W 1539 nt7.32□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 PDC5YLR134W 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
YAR028WP39548 ERO1YML130C 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.7 ms