Protein–RNA interactions for Protein: P36534

MRPL40, 54S ribosomal protein L40, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL40P36534 PIH1YHR034C 1035 nt7.57□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 STE3YKL178C 1413 nt7.57□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 KTR4YBR199W 1395 nt7.57□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 ERR3YMR323W 1314 nt7.56□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 ERR1YOR393W 1314 nt7.56□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 ERR2YPL281C 1314 nt7.56□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 NCA3YJL116C 1014 nt7.56□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 YMR253CYMR253C 1245 nt7.56□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 CBK1YNL161W 2271 nt7.55□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 YJR142WYJR142W 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 MGM101YJR144W 810 nt7.55□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 DST1YGL043W 930 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 URA1YKL216W 945 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 ATP23YNR020C 813 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 INP54YOL065C 1155 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 MSI1YBR195C 1269 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 FCP1YMR277W 2199 nt7.54□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 SPE4YLR146C 903 nt7.53□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 YNL295WYNL295W 1575 nt7.53□□□□□ -1.2
MRPL40P36534 FTH1YBR207W 1398 nt7.52□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 PSA1YDL055C 1086 nt7.52□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.52□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 AOS1YPR180W 1044 nt7.52□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 LAT1YNL071W 1449 nt7.52□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YGL081WYGL081W 963 nt7.51□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 DOC1YGL240W 753 nt7.51□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 NMA2YGR010W 1188 nt7.51□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 AQR1YNL065W 1761 nt7.51□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 MTC6YHR151C 1581 nt7.5□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 CDC13YDL220C 2775 nt7.5□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YHR033WYHR033W 1272 nt7.5□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 HAM1YJR069C 594 nt7.5□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YBL111CYBL111C 2004 nt7.5□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 MLS1YNL117W 1665 nt7.49□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 CDA1YLR307W 906 nt7.49□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.49□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 ELP6YMR312W 822 nt7.49□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 HRB1YNL004W 1365 nt7.48□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 OSM1YJR051W 1506 nt7.48□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YOX1YML027W 1158 nt7.48□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 GET2YER083C 858 nt7.47□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 MDH2YOL126C 1134 nt7.47□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 YPT10YBR264C 600 nt7.47□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 SPS1YDR523C 1473 nt7.47□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 CDC3YLR314C 1563 nt7.46□□□□□ -1.21
MRPL40P36534 PTH2YBL057C 627 nt7.46□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 DSC3YOR223W 879 nt7.46□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 DIA4YHR011W 1341 nt7.46□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PPZ2YDR436W 2133 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 NAS6YGR232W 687 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PRY2YKR013W 990 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 EDC3YEL015W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 HSM3YBR272C 1443 nt7.44□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PIL1YGR086C 1020 nt7.43□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PET10YKR046C 852 nt7.42□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PRP2YNR011C 2631 nt7.41□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 YPC1YBR183W 951 nt7.41□□□□□ -1.22
MRPL40P36534 PEX28YHR150W 1740 nt7.4□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 TOS2YGR221C 1869 nt7.4□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 UBP13YBL067C 2244 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 POB3YML069W 1659 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 UME1YPL139C 1383 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YDR215CYDR215C 414 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 DAL80YKR034W 810 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YPQ1YOL092W 927 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YPL067CYPL067C 597 nt7.39□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 ADE17YMR120C 1779 nt7.38□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 SKP1YDR328C 585 nt7.38□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 CKB1YGL019W 837 nt7.38□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 OPI1YHL020C 1215 nt7.38□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 AGP2YBR132C 1791 nt7.38□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YJL144WYJL144W 315 nt7.37□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 PRS4YBL068W 981 nt7.37□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 CST26YBR042C 1194 nt7.37□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YPL264CYPL264C 1062 nt7.37□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 TPO1YLL028W 1761 nt7.37□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 ICL2YPR006C 1728 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 TRR1YDR353W 960 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YIP4YGL198W 708 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 AIM46YHR199C 933 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YML122CYML122C 381 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 AVL9YLR114C 2295 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 VTS1YOR359W 1572 nt7.36□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 TRR2YHR106W 1029 nt7.35□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YJL213WYJL213W 996 nt7.35□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 PAM17YKR065C 594 nt7.35□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 CAR2YLR438W 1275 nt7.34□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 ERV25YML012W 636 nt7.34□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 BDS1YOL164W 1941 nt7.34□□□□□ -1.23
MRPL40P36534 YOS9YDR057W 1629 nt7.34□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 ASN2YGR124W 1719 nt7.33□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 AAD14YNL331C 1131 nt7.33□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 YOR111WYOR111W 699 nt7.33□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 NMD5YJR132W 3147 nt7.32□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 CYS3YAL012W 1185 nt7.32□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 SNF7YLR025W 723 nt7.32□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 MCP1YOR228C 909 nt7.32□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 MBF1YOR298C-A 456 nt7.32□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 ACO1YLR304C 2337 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms