Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM23P36406 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM23P36406 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms