Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG3P32926 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG3P32926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG3P32926 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DSG3P32926 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DSG3P32926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DSG3P32926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DSG3P32926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DSG3P32926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DSG3P32926 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DSG3P32926 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DSG3P32926 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DSG3P32926 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DSG3P32926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG3P32926 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG3P32926 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG3P32926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG3P32926 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG3P32926 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG3P32926 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG3P32926 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG3P32926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG3P32926 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG3P32926 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DSG3P32926 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DSG3P32926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DSG3P32926 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DSG3P32926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DSG3P32926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DSG3P32926 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DSG3P32926 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DSG3P32926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSG3P32926 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSG3P32926 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSG3P32926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DSG3P32926 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSG3P32926 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG3P32926 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DSG3P32926 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DSG3P32926 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DSG3P32926 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DSG3P32926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DSG3P32926 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DSG3P32926 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DSG3P32926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DSG3P32926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DSG3P32926 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DSG3P32926 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DSG3P32926 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DSG3P32926 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DSG3P32926 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DSG3P32926 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DSG3P32926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DSG3P32926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DSG3P32926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DSG3P32926 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DSG3P32926 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DSG3P32926 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DSG3P32926 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSG3P32926 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DSG3P32926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSG3P32926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSG3P32926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSG3P32926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSG3P32926 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSG3P32926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSG3P32926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSG3P32926 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DSG3P32926 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DSG3P32926 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DSG3P32926 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DSG3P32926 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DSG3P32926 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms