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Protein–RNA interactions for Protein: P32500
NDC1, Nucleoporin NDC1, yeast
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655 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
NDC1
P32500
ECM27
YJR106W
2178 nt
6.85
□□□□□ -1.31
NDC1
P32500
MSS51
YLR203C
1311 nt
6.84
□□□□□ -1.31
NDC1
P32500
SWM1
YDR260C
513 nt
6.84
□□□□□ -1.31
NDC1
P32500
PAU19
YMR325W
375 nt
6.84
□□□□□ -1.31
NDC1
P32500
RTC2
YBR147W
891 nt
6.84
□□□□□ -1.31
NDC1
P32500
YPR084W
YPR084W
1371 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YGL260W
YGL260W
231 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
DAL80
YKR034W
810 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
SEN2
YLR105C
1134 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
STE3
YKL178C
1413 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
ENB1
YOL158C
1821 nt
6.83
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
CAN1
YEL063C
1773 nt
6.82
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
TRR1
YDR353W
960 nt
6.82
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YAH1
YPL252C
519 nt
6.81
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
ICL2
YPR006C
1728 nt
6.81
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YNL295W
YNL295W
1575 nt
6.8
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YKL147C
YKL147C
618 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
PRY2
YKR013W
990 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YML034C-A
YML034C-A
399 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
PPS1
YBR276C
2424 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
PAB1
YER165W
1734 nt
6.79
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
UTR5
YEL035C
501 nt
6.78
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YIL168W
YIL168W
384 nt
6.78
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YNR001W-A
YNR001W-A
219 nt
6.78
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
FCY2
YER056C
1602 nt
6.78
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
BAP3
YDR046C
1815 nt
6.78
□□□□□ -1.32
NDC1
P32500
YCR061W
YCR061W
1896 nt
6.77
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
AFG3
YER017C
2286 nt
6.77
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
OPI1
YHL020C
1215 nt
6.77
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
LIP5
YOR196C
1245 nt
6.77
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
AGP2
YBR132C
1791 nt
6.77
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
YDR327W
YDR327W
327 nt
6.76
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
LOT6
YLR011W
576 nt
6.76
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
RFS1
YBR052C
633 nt
6.76
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
YHR131C
YHR131C
2553 nt
6.76
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
BDS1
YOL164W
1941 nt
6.76
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
INP54
YOL065C
1155 nt
6.75
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
RRP43
YCR035C
1185 nt
6.74
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
HRA1
HRA1
564 nt
6.74
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
MFT1
YML062C
1179 nt
6.74
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
NUP57
YGR119C
1626 nt
6.74
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
YOR389W
YOR389W
1875 nt
6.73
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
CSM2
YIL132C
642 nt
6.73
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
EXG2
YDR261C
1689 nt
6.73
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
GET2
YER083C
858 nt
6.72
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
VTS1
YOR359W
1572 nt
6.72
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
NUP84
YDL116W
2181 nt
6.72
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
ERG24
YNL280C
1317 nt
6.72
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
SSC1
YJR045C
1965 nt
6.71
□□□□□ -1.33
NDC1
P32500
ACO1
YLR304C
2337 nt
6.7
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YOR012W
YOR012W
414 nt
6.7
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
SPS1
YDR523C
1473 nt
6.7
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
HEL1
YKR017C
1656 nt
6.7
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
PPZ2
YDR436W
2133 nt
6.7
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YCP4
YCR004C
744 nt
6.69
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
SNF4
YGL115W
969 nt
6.69
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YMR007W
YMR007W
381 nt
6.69
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YCR041W
YCR041W
333 nt
6.67
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
TDH1
YJL052W
999 nt
6.67
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
MGM101
YJR144W
810 nt
6.67
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
RDR1
YOR380W
1641 nt
6.67
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
PUP1
YOR157C
786 nt
6.66
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
ADA2
YDR448W
1305 nt
6.66
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
SPR1
YOR190W
1338 nt
6.66
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
PSA1
YDL055C
1086 nt
6.65
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YLR112W
YLR112W
420 nt
6.65
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
YPT10
YBR264C
600 nt
6.65
□□□□□ -1.34
NDC1
P32500
CDC3
YLR314C
1563 nt
6.65
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
PSP2
YML017W
1782 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
TOS2
YGR221C
1869 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
PAC10
YGR078C
600 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
MEU1
YLR017W
1014 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
SLG1
YOR008C
1137 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
SRF1
YDL133W
1314 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
ERG12
YMR208W
1332 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
PNS1
YOR161C
1620 nt
6.64
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
HHY1
YEL059W
309 nt
6.63
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
AIM2
YAL049C
741 nt
6.63
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
CBK1
YNL161W
2271 nt
6.63
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
DSC3
YOR223W
879 nt
6.63
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
CDC7
YDL017W
1524 nt
6.62
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
HSM3
YBR272C
1443 nt
6.62
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
ERV2
YPR037C
591 nt
6.62
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
SEC23
YPR181C
2307 nt
6.61
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
HAC1
YFL031W
717 nt
6.61
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
CPT1
YNL130C
1182 nt
6.61
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
ELP4
YPL101W
1371 nt
6.6
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
EFM1
YHL039W
1758 nt
6.6
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
YMR074C
YMR074C
438 nt
6.6
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
RCR1
YBR005W
642 nt
6.6
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
PGI1
YBR196C
1665 nt
6.6
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
SKP1
YDR328C
585 nt
6.59
□□□□□ -1.35
NDC1
P32500
KIN1
YDR122W
3195 nt
6.58
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
SUN4
YNL066W
1263 nt
6.58
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
PHO85
YPL031C
918 nt
6.58
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
MLS1
YNL117W
1665 nt
6.58
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
DAL7
YIR031C
1665 nt
6.57
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
6.56
□□□□□ -1.36
NDC1
P32500
MHP1
YJL042W
4197 nt
6.56
□□□□□ -1.36
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