Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP1P32455 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP1P32455 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP1P32455 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP1P32455 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP1P32455 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GBP1P32455 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GBP1P32455 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP1P32455 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP1P32455 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP1P32455 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP1P32455 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP1P32455 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP1P32455 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP1P32455 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP1P32455 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP1P32455 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP1P32455 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP1P32455 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP1P32455 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP1P32455 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP1P32455 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP1P32455 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP1P32455 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP1P32455 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP1P32455 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP1P32455 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP1P32455 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP1P32455 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP1P32455 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP1P32455 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP1P32455 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP1P32455 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP1P32455 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP1P32455 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP1P32455 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP1P32455 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP1P32455 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP1P32455 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP1P32455 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP1P32455 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP1P32455 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP1P32455 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP1P32455 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP1P32455 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP1P32455 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP1P32455 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP1P32455 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP1P32455 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP1P32455 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP1P32455 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP1P32455 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP1P32455 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP1P32455 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP1P32455 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP1P32455 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP1P32455 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms