Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJB1P25685 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAJB1P25685 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJB1P25685 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB1P25685 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB1P25685 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms