Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPH2P23942 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPH2P23942 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPH2P23942 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPH2P23942 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPH2P23942 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPH2P23942 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPH2P23942 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPH2P23942 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms