Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRDP23468 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRDP23468 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRDP23468 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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