Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA6P23280 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA6P23280 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA6P23280 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA6P23280 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA6P23280 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA6P23280 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA6P23280 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CA6P23280 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA6P23280 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA6P23280 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA6P23280 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA6P23280 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CA6P23280 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA6P23280 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA6P23280 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA6P23280 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CA6P23280 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA6P23280 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA6P23280 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA6P23280 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA6P23280 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA6P23280 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA6P23280 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CA6P23280 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA6P23280 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA6P23280 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA6P23280 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA6P23280 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CA6P23280 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA6P23280 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA6P23280 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA6P23280 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA6P23280 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA6P23280 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA6P23280 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA6P23280 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA6P23280 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA6P23280 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA6P23280 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA6P23280 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA6P23280 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA6P23280 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA6P23280 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA6P23280 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA6P23280 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA6P23280 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA6P23280 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA6P23280 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA6P23280 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA6P23280 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA6P23280 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA6P23280 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA6P23280 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA6P23280 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA6P23280 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA6P23280 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CA6P23280 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CA6P23280 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CA6P23280 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms