Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFEBP19484 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFEBP19484 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFEBP19484 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFEBP19484 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFEBP19484 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFEBP19484 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFEBP19484 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFEBP19484 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFEBP19484 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFEBP19484 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFEBP19484 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFEBP19484 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFEBP19484 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFEBP19484 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFEBP19484 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFEBP19484 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFEBP19484 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFEBP19484 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFEBP19484 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFEBP19484 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFEBP19484 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFEBP19484 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFEBP19484 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFEBP19484 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFEBP19484 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFEBP19484 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFEBP19484 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFEBP19484 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFEBP19484 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFEBP19484 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFEBP19484 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFEBP19484 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFEBP19484 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFEBP19484 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFEBP19484 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFEBP19484 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFEBP19484 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFEBP19484 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFEBP19484 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFEBP19484 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFEBP19484 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFEBP19484 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFEBP19484 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFEBP19484 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFEBP19484 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFEBP19484 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFEBP19484 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFEBP19484 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFEBP19484 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFEBP19484 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFEBP19484 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFEBP19484 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFEBP19484 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFEBP19484 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFEBP19484 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFEBP19484 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFEBP19484 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms