Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN1P18031 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN1P18031 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN1P18031 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN1P18031 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN1P18031 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms