Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT1P17948 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT1P17948 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT1P17948 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT1P17948 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT1P17948 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT1P17948 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT1P17948 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT1P17948 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT1P17948 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT1P17948 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT1P17948 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT1P17948 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT1P17948 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT1P17948 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT1P17948 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT1P17948 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT1P17948 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT1P17948 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT1P17948 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT1P17948 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT1P17948 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT1P17948 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT1P17948 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT1P17948 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT1P17948 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT1P17948 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT1P17948 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT1P17948 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT1P17948 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT1P17948 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT1P17948 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT1P17948 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT1P17948 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT1P17948 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT1P17948 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT1P17948 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT1P17948 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT1P17948 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT1P17948 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT1P17948 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT1P17948 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT1P17948 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT1P17948 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT1P17948 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT1P17948 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT1P17948 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT1P17948 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT1P17948 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT1P17948 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT1P17948 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT1P17948 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT1P17948 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT1P17948 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT1P17948 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT1P17948 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT1P17948 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT1P17948 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT1P17948 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FLT1P17948 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT1P17948 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT1P17948 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms