Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP2P16035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP2P16035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIMP2P16035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP2P16035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms