Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPGDP15428 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPGDP15428 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPGDP15428 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPGDP15428 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDP15428 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPGDP15428 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDP15428 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDP15428 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDP15428 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDP15428 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPGDP15428 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPGDP15428 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPGDP15428 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPGDP15428 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPGDP15428 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPGDP15428 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPGDP15428 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPGDP15428 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPGDP15428 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPGDP15428 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDP15428 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDP15428 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPGDP15428 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDP15428 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDP15428 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPGDP15428 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPGDP15428 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDP15428 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDP15428 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDP15428 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDP15428 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPGDP15428 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDP15428 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDP15428 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDP15428 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPGDP15428 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPGDP15428 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPGDP15428 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPGDP15428 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPGDP15428 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPGDP15428 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPGDP15428 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms