Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL4AP11441 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL4AP11441 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBL4AP11441 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL4AP11441 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL4AP11441 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms