Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR2F1P10589 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F1P10589 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2F1P10589 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2F1P10589 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms