Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2MP0CAP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2MP0CAP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2MP0CAP2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2MP0CAP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2MP0CAP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2MP0CAP2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR2MP0CAP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2MP0CAP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR2MP0CAP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms