Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4BP0C0L5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
C4BP0C0L5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
C4BP0C0L5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C4BP0C0L5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
C4BP0C0L5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C4BP0C0L5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
C4BP0C0L5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C4BP0C0L5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms