Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
POLA1P09884 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
POLA1P09884 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
POLA1P09884 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
POLA1P09884 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
POLA1P09884 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
POLA1P09884 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
POLA1P09884 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
POLA1P09884 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
POLA1P09884 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
POLA1P09884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
POLA1P09884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
POLA1P09884 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
POLA1P09884 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
POLA1P09884 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
POLA1P09884 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
POLA1P09884 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
POLA1P09884 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.99■■■■■ 4.47
POLA1P09884 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
POLA1P09884 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
POLA1P09884 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
POLA1P09884 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
POLA1P09884 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
POLA1P09884 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
POLA1P09884 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
POLA1P09884 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
POLA1P09884 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
POLA1P09884 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
POLA1P09884 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
POLA1P09884 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
POLA1P09884 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
POLA1P09884 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
POLA1P09884 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
POLA1P09884 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
POLA1P09884 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
POLA1P09884 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
POLA1P09884 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
POLA1P09884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
POLA1P09884 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
POLA1P09884 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
POLA1P09884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
POLA1P09884 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
POLA1P09884 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
POLA1P09884 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
POLA1P09884 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
POLA1P09884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
POLA1P09884 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
POLA1P09884 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
POLA1P09884 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
POLA1P09884 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
POLA1P09884 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
POLA1P09884 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
POLA1P09884 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
POLA1P09884 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
POLA1P09884 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
POLA1P09884 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
POLA1P09884 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
POLA1P09884 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
POLA1P09884 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
POLA1P09884 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
POLA1P09884 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
POLA1P09884 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
POLA1P09884 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
POLA1P09884 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
POLA1P09884 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
POLA1P09884 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
POLA1P09884 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
POLA1P09884 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
POLA1P09884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
POLA1P09884 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
POLA1P09884 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
POLA1P09884 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
POLA1P09884 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
POLA1P09884 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
POLA1P09884 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
POLA1P09884 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
POLA1P09884 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
POLA1P09884 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
POLA1P09884 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
POLA1P09884 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms