Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUDT3O95989 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUDT3O95989 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUDT3O95989 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUDT3O95989 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms