Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST3O95803 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST3O95803 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST3O95803 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST3O95803 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST3O95803 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST3O95803 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST3O95803 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST3O95803 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST3O95803 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST3O95803 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST3O95803 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST3O95803 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST3O95803 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST3O95803 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST3O95803 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST3O95803 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST3O95803 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST3O95803 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST3O95803 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST3O95803 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST3O95803 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST3O95803 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST3O95803 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST3O95803 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST3O95803 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST3O95803 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST3O95803 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST3O95803 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST3O95803 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST3O95803 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST3O95803 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST3O95803 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST3O95803 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST3O95803 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST3O95803 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST3O95803 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST3O95803 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST3O95803 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST3O95803 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST3O95803 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST3O95803 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST3O95803 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST3O95803 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST3O95803 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST3O95803 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST3O95803 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST3O95803 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST3O95803 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST3O95803 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST3O95803 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST3O95803 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST3O95803 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST3O95803 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST3O95803 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST3O95803 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST3O95803 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST3O95803 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST3O95803 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST3O95803 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST3O95803 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST3O95803 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST3O95803 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDST3O95803 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST3O95803 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST3O95803 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST3O95803 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDST3O95803 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDST3O95803 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST3O95803 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST3O95803 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms