Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSDE1O75534 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSDE1O75534 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSDE1O75534 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSDE1O75534 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSDE1O75534 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSDE1O75534 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSDE1O75534 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSDE1O75534 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSDE1O75534 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSDE1O75534 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CSDE1O75534 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CSDE1O75534 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CSDE1O75534 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms