Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMPCBO75439 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PMPCBO75439 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PMPCBO75439 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms