Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HTATSF1O43719 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HTATSF1O43719 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
HTATSF1O43719 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HTATSF1O43719 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms