Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF1O43189 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF1O43189 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF1O43189 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF1O43189 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF1O43189 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF1O43189 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF1O43189 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF1O43189 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF1O43189 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF1O43189 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF1O43189 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF1O43189 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF1O43189 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF1O43189 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF1O43189 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF1O43189 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF1O43189 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF1O43189 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF1O43189 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF1O43189 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF1O43189 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF1O43189 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF1O43189 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF1O43189 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF1O43189 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF1O43189 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF1O43189 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF1O43189 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF1O43189 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF1O43189 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF1O43189 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF1O43189 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF1O43189 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF1O43189 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF1O43189 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms