Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAMP3O14828 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAMP3O14828 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAMP3O14828 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAMP3O14828 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAMP3O14828 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAMP3O14828 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAMP3O14828 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAMP3O14828 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms