Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOCS6O14544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOCS6O14544 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOCS6O14544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOCS6O14544 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS6O14544 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS6O14544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS6O14544 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS6O14544 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms