Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR4O00206 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR4O00206 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR4O00206 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR4O00206 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR4O00206 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR4O00206 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR4O00206 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR4O00206 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR4O00206 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR4O00206 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR4O00206 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR4O00206 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR4O00206 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR4O00206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR4O00206 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR4O00206 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR4O00206 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR4O00206 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR4O00206 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR4O00206 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR4O00206 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR4O00206 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR4O00206 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR4O00206 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR4O00206 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR4O00206 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR4O00206 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR4O00206 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR4O00206 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR4O00206 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR4O00206 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR4O00206 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLR4O00206 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLR4O00206 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR4O00206 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR4O00206 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR4O00206 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR4O00206 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR4O00206 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR4O00206 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR4O00206 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR4O00206 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR4O00206 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR4O00206 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR4O00206 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR4O00206 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR4O00206 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR4O00206 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR4O00206 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR4O00206 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR4O00206 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR4O00206 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR4O00206 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR4O00206 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms