Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAPO00193 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAPO00193 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAPO00193 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAPO00193 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAPO00193 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAPO00193 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAPO00193 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAPO00193 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAPO00193 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAPO00193 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAPO00193 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAPO00193 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAPO00193 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAPO00193 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAPO00193 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAPO00193 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAPO00193 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAPO00193 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAPO00193 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAPO00193 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAPO00193 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAPO00193 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAPO00193 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAPO00193 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAPO00193 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAPO00193 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAPO00193 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAPO00193 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAPO00193 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAPO00193 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAPO00193 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAPO00193 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAPO00193 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAPO00193 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAPO00193 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAPO00193 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAPO00193 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAPO00193 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMAPO00193 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMAPO00193 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAPO00193 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAPO00193 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAPO00193 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAPO00193 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAPO00193 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAPO00193 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAPO00193 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAPO00193 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAPO00193 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAPO00193 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAPO00193 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAPO00193 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAPO00193 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAPO00193 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAPO00193 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAPO00193 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAPO00193 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAPO00193 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAPO00193 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAPO00193 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAPO00193 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAPO00193 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAPO00193 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAPO00193 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAPO00193 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAPO00193 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAPO00193 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAPO00193 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAPO00193 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAPO00193 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAPO00193 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAPO00193 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAPO00193 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAPO00193 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAPO00193 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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