Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM22K7EJ46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMIM22K7EJ46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM22K7EJ46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM22K7EJ46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM22K7EJ46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms