Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
E9PCH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
E9PCH4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
E9PCH4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
E9PCH4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
E9PCH4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
E9PCH4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
E9PCH4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
E9PCH4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
E9PCH4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
E9PCH4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
E9PCH4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
E9PCH4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
E9PCH4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
E9PCH4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
E9PCH4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
E9PCH4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
E9PCH4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
E9PCH4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
E9PCH4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
E9PCH4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
E9PCH4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
E9PCH4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
E9PCH4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
E9PCH4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
E9PCH4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
E9PCH4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
E9PCH4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
E9PCH4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
E9PCH4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
E9PCH4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
E9PCH4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
E9PCH4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
E9PCH4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
E9PCH4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
E9PCH4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
E9PCH4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
E9PCH4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
E9PCH4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
E9PCH4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
E9PCH4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
E9PCH4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
E9PCH4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
E9PCH4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
E9PCH4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
E9PCH4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
E9PCH4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
E9PCH4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
E9PCH4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37■■■■□ 3.51
E9PCH4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
E9PCH4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
E9PCH4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
E9PCH4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
E9PCH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
E9PCH4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
E9PCH4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
E9PCH4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
E9PCH4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
E9PCH4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
E9PCH4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
E9PCH4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
E9PCH4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
E9PCH4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
E9PCH4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
E9PCH4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
E9PCH4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
E9PCH4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
E9PCH4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
E9PCH4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
E9PCH4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
E9PCH4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
E9PCH4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
E9PCH4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
E9PCH4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
E9PCH4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
E9PCH4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
E9PCH4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
E9PCH4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
E9PCH4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
E9PCH4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
E9PCH4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
E9PCH4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
E9PCH4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
E9PCH4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
E9PCH4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
E9PCH4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms