Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9J4A7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9J4A7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9J4A7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9J4A7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9J4A7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9J4A7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9J4A7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9J4A7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9J4A7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9J4A7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9J4A7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9J4A7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9J4A7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9J4A7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9J4A7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9J4A7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9J4A7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9J4A7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9J4A7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C9J4A7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C9J4A7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C9J4A7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9J4A7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9J4A7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9J4A7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C9J4A7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9J4A7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9J4A7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9J4A7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9J4A7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9J4A7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9J4A7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9J4A7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9J4A7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9J4A7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9J4A7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9J4A7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9J4A7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9J4A7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9J4A7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9J4A7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9J4A7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9J4A7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9J4A7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9J4A7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9J4A7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9J4A7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9J4A7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C9J4A7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9J4A7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9J4A7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9J4A7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9J4A7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9J4A7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9J4A7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9J4A7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9J4A7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9J4A7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9J4A7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9J4A7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9J4A7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9J4A7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9J4A7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms