Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIIAD1A6NNX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RIIAD1A6NNX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIIAD1A6NNX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms