Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NL46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NL46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NL46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NL46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NL46 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NL46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NL46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NL46 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NL46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NL46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NL46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NL46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NL46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NL46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NL46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NL46 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NL46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NL46 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NL46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NL46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NL46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NL46 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NL46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NL46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NL46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NL46 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NL46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NL46 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NL46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NL46 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NL46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NL46 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NL46 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NL46 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NL46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NL46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NL46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NL46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NL46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NL46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NL46 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NL46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NL46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NL46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NL46 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NL46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NL46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms