Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-6A6NCS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-6A6NCS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-6A6NCS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-6A6NCS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms