Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PPC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A1W2PPC4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PPC4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms