RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)P

tT(UGU)P, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(UGU)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)PtT(UGU)P YBR056W-AI2HB52 66 aa0.2□□□□□ -2.38
tT(UGU)PtT(UGU)P FMP27Q06179 2628 aa0.12□□□□□ -2.39
tT(UGU)PtT(UGU)P PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
tT(UGU)PtT(UGU)P TOR2P32600 2474 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
tT(UGU)PtT(UGU)P GCN1P33892 2672 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
tT(UGU)PtT(UGU)P TAO3P40468 2376 aa0.03□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P YPR117WQ06116 2489 aa0.03□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P TOR1P35169 2470 aa0.02□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P NUM1Q00402 2748 aa-0□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P CSF1Q12150 2958 aa-0.01□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P TEL1P38110 2787 aa-0.01□□□□□ -2.41
tT(UGU)PtT(UGU)P MEC1P38111 2368 aa-0.06□□□□□ -2.42
tT(UGU)PtT(UGU)P UTP20P35194 2493 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
tT(UGU)PtT(UGU)P MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
tT(UGU)PtT(UGU)P YDR344CQ05510 147 aa-0.09□□□□□ -2.42
tT(UGU)PtT(UGU)P NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.12□□□□□ -2.43not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
tT(UGU)PtT(UGU)P IRA2P19158 3079 aa-0.12□□□□□ -2.43
tT(UGU)PtT(UGU)P FAB1P34756 2278 aa-0.13□□□□□ -2.43
tT(UGU)PtT(UGU)P GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
tT(UGU)PtT(UGU)P RGA2Q06407 1009 aa-0.15□□□□□ -2.43
tT(UGU)PtT(UGU)P IRA1P18963 3092 aa-0.17□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P ILV3P39522 585 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P HFA1P32874 2273 aa-0.2□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P DBP2P24783 546 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P SLX1P38324 304 aa-0.2□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P URA2P07259 2214 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P ATS1P31386 333 aa-0.21□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P LAS17Q12446 633 aa-0.21□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P VPS13Q07878 3144 aa-0.21□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P POL2P21951 2222 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P NOP1P15646 327 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P YEF3P16521 1044 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P MPE1P35728 441 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tT(UGU)PtT(UGU)P SEA4P38164 1038 aa-0.23□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P BPH1P25356 2167 aa-0.23□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P SEC16P48415 2195 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.24□□□□□ -2.45not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P ITT1Q04638 464 aa-0.24□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P BEM2P39960 2167 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P SCJ1P25303 377 aa-0.26□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P PIB1Q06651 286 aa-0.26□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P TOM1Q03280 3268 aa-0.26□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P DYN1P36022 4092 aa-0.27□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P BRR2P32639 2163 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P SDH2P21801 266 aa-0.27□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P DED1P06634 604 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tT(UGU)PtT(UGU)P ADP1P25371 1049 aa-0.29□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P TRA1P38811 3744 aa-0.3□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P RPS2P25443 254 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P HEF3P53978 1044 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P SRC1Q03707 834 aa-0.3□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P RIB2Q12362 591 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.31□□□□□ -2.46not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P RGA1P39083 1007 aa-0.31□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P LSM4P40070 187 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P RPS29AP41057 56 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P HST2P53686 357 aa-0.31□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P AIR2Q12476 344 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P SAL1D6W196 494 aa-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P NFS1P25374 497 aa-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P PEX2P32800 271 aa-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P MOT2P34909 587 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P DED81P38707 554 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.32□□□□□ -2.46not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P FAP1P53971 965 aa-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P PSH1Q12161 406 aa-0.32□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P RAM1P22007 431 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.33□□□□□ -2.46not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P TIF3P34167 436 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P VRP1P37370 817 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P CAF40P53829 373 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P GLO2Q05584 274 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P FRT1Q99332 602 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P CCH1P50077 2039 aa-0.33□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P BI4P03879 638 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P KTR4P38131 464 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P YBL086CP38177 466 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P PZF1P39933 429 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P FKH1P40466 484 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P DUO1P53168 247 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P GIS1Q03833 894 aa-0.34□□□□□ -2.46
tT(UGU)PtT(UGU)P YSC84P32793 468 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P UBA4P38820 440 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P AXL1P40851 1208 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P SNM1P40993 198 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P ZAP1P47043 880 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P CLA4P48562 842 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P CST9Q06032 482 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P TFC6Q06339 672 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P PNS1Q12412 539 aa-0.35□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P LSB5P25369 354 aa-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P GAR1P28007 205 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P KIP2P28743 706 aa-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P ASH1P34233 588 aa-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P AIM3P38266 947 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P TOS1P38288 455 aa-0.36□□□□□ -2.47
tT(UGU)PtT(UGU)P MTC4P38335 694 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms